Kyrkomiljön ingår i ett område av riksintresse för kulturmiljövården (Sigtuna stad, K 65). Sigtuna är en av landets äldsta ännu existerande och under den tidiga medeltiden mest betydelsefulla städer. Staden har fler kyrkoruiner i utkanten av det medeltida stadsområdet och en småskalig trästadsbebyggelse.
Mariakyrkan ligger i utkanten av stadskärnan i ett kvarter med trekantig form omfattande kyrkan med kyrkogård, S:t Olofs kyrkoruin, församlingshemmet Munken, samt Sigtuna brandstation. Kvarteret omges av Uppsalavägen, Prästgatan och Olofsgatan. Klockstapeln står på Klockbacken, en höjd öster om kyrkan, omgiven av ett fornlämningsområde med gravfält.